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蛋白复合物查询数据库CORUM

在蛋白发生生物学功能的时候,经常是不同不同的蛋白组成不同的复合物来发挥作用的。我们在做一些基础实验的时候,经常也需要通过实验手段来确定和这个蛋白直接相关的其他蛋白。所以今天就给大家介绍一个基于文件汇总的蛋白复合物查询数据库:CORUM: https://mips.helmholtz-muenchen.de/corum/# 

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背景数据集介绍

为了保证蛋白复合物结果的准确性,对于一些基于高通量测序获得的结果,作者并没有包含到其中, CORUM 的主要数据来源是那些基于基础实验而获得的蛋白复合物结果。经过收集,作者得到了 4274 个蛋白复合体信息。

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数据库使用

在 CORUM 当中,输入想要检索的蛋白名称就可以得到和这个蛋白有关的复合物结果。比如我们输入TP53

检索结果当中包含了人类和老鼠两个主要的物种。

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点击想要了解的每一个复合物,就可以看到这个复合物的具体信息,其中包括:这个复合物的主要检测方法,复合物有关的功能以及复合物结果的参考文献。




总的来说

以上就是关于 CORUM 的主要使用过程了。如果想要了解确切的关于蛋白蛋白之间复合物信息的话,这样基于实验的结果相对来说要更准确一些。如果要说不足的话,也是目前 CORUM 3.0 是三年之前公布的。数据相对来说也不是很新了。所以可以期待一些 4.0 版本吧



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